根据中央建设创新型国家的总体战略目标和国家中长期科技发展规划纲要，结合中国科学院科技布局调整的要求，围绕深圳市实施创新型城市战略，2006年２月，中国科学院、深圳市人民政府友好协商，在深圳市共同建立中国科学院深圳先进技术研究院（以下简称先进院）。先进技术院由先进集成技术研究所、生物医学与健康工程研究所、先进计算与数字工程研究所、开放技术平台、工程中心、行政管理部门等部分组成，同时设立学术委员会、工业委员会。
 

　　中国科学院香港中文大学深圳先进集成技术研究所由中国科学院、深圳市人民政府和香港中文大学协商共建，致力于现代装备制造业及服务业的基础性、前瞻性、战略性的研究。
 

　　中国科学院深圳先进技术研究院生物医学与健康工程研究所为先进技术院的主要研究单元之一，致力于低成本、集成化、网络化、智能化的创新医疗设备的研究。
 

　　中国科学院深圳先进技术研究院先进计算与数字工程研究所为先进技术院的主要研究单元之一，致力于数字城市、数字生态、数字工程等应用领域的高性能计算技术、网格技术、智能技术与仿真模拟技术研究。
开放技术平台由一系列基于仪器设备支撑的实验室组成，为先进技术院科技活动提供测试、调试、加工等技术支撑与服务，并向企业和其它科研单位开放。经过5至10年的发展，成为区域技术创新平台的重要组成部分。