孙喜亭教授论文的特点之一，是教学与科研的统一。他常说：教授不上课，何谓教授，教授不作科研，怎能上好课。他研究的许多理论问题，都是教学内容所涉及的教育基本理论问题。研究以教学为起点，然后将研究成果引进教学，使教学和科研融为一体，这就使教学常新，又使研究融于理性之中。因此，他的论文特别重视概念要明确，内涵要确定，理论建构逻辑要严谨。理论的力量实际就是逻辑的力量，他力图理论要彻底，所谓彻底就是科学，只有科学，才能说服人，才能指导教育实践不随意，不盲目。他的研究带学院派的特色气息。

　　他的论文另一特点是对中国教育实践的密切关注。如对教育方针表述的科学性问题，对教育在社会发展中的地位问题、对教育是不是生产力或产业问题，素质与教育的关系问题，基础教育的基础问题，教学改革向何处的问题，德育价值何在的问题，知识分子阶级属性的归属问题等。反映这些问题的论文，都是从实际出发，以求理论的解答，以求理性认识与实践的统一。他认为就理论谈理论，文章显得毫无生气，就实际说实际，那就失去了科学研究（或论文）的意义，理论要从实际出发，但理论要高于实践并指导实践。他说的实际并非一时一事的个案，也不是某一价值取向所产生的教育事实，而是与经济和社会发展相适应的教育总体，是与时代发展相适应的教育总的趋势。与时俱进而不趋时，理论创新而不违背规律，是他执着以求的。　

　　论文的特点之三，是文人的统一。作者认为作为科学研究唯一的目标就是求真求实，应该力戒虚伪、吹捧之风。因此，他的论文不追风，不迎合，只求真，不看人，论文中的观点可能偏颇，但他是为了求真。为了求真求实，他的论文力求观点鲜明，在他论文中主张什么，反对什么；肯定什么，反对什么；称道什么，抨击什么，都表达得十分明快。作者认为在学术研究领域，应是学术自由，学术民主。不应有职务职称之分，不应有长幼年龄之别，唯一的标准是求真，是见解是否客观，是否科学。在求真面前人人是平等的。他有些论文观点是？quot；权威”的主张相悖的，有些论文观点又是与他的学生所进行的商榷。他不认为自己的观点就是科学的，但他愿欲共同商讨。因此，他的论文带有论争的特点。

　　他说过，在几十年的教育科研上他是尽力了，但并未达到好的境界，他是执着追求了，但可能偏执了，是尽力想把问题弄清楚、但可能使人更糊涂了。他认为，做人处世是难得糊涂，科学研究是难得清楚。　

　　他的研究成果，反映着他所处时代的背景，他又是他时代背景下的人。因此，他所受的教育，他的知识结构，他的思维定势，他的科研方法，不能不有他的局限。所以有局限的“文集”若能引起争议，也可算作他研究成果的一种积极体现吧。